Drajvere, naravno, nećeš pokretati preko Wine-a, već ćeš koristiti drajvere koji su pisani za Linux.
JDownloader, Skype će raditii bez Wine-a, za ostale nisam siguran, najbolje da instaliraš Ubuntu pored Windows-a (dual boot) i programe koje ne možeš koristiti na Ubuntu-u koristi na Windows-u...